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/skin/pukiwiki.css.php

div.ie5 { text-align:center; }

書いてある通り、ie5などではその改造が正解です。ie5より新しいieやその他のブラウザでは以下のようにします。

.style_table {
	padding:0px;
	border:0px;
	margin:auto;            /*この行を削ってください*/
	margin:1em auto 1em 0;  /*このように追加してください*/
	text-align:left;
	color:inherit;
	background-color:#ccd5dd;
}

マージンを、上下1em、右側を自動、左側をゼロにしました。これで、左側のマージンはなくなります。